Chemioterapia wpływa na organizm pacjenta w wielu aspektach. Większość stosowanych w chemioterapii leków źle oddziałuje na system immunologiczny. Skutkiem tego jest obniżenie odporności na infekcje. Pacjenci łatwiej zapadają na różnego rodzaju choroby oraz częściej łagodne infekcje przekształcają się w poważniejsze stany chorobowe.